禽类曲霉病主要侵袭下呼吸道（别名 孵化器肺炎、霉菌性肺炎、真菌性肺病）。较少定植于眼、脑、皮肤、关节和内脏，也可引发全身性感染。曲霉病可以是急性的，也可以 是慢性的。急性病在雏鸡、雏鸭、雏鹅中通常表现为爆发性 ——高发病率和高死亡率。成年禽类通常是慢性感染。
一、病原学和流行病学
烟曲霉是曲霉病最常见的病原，有时也能分离出黄曲霉、黑曲霉、灰绿曲霉和土曲霉。 这些真菌是世界各地常见的土壤腐生物，生长在温暖(>25°C)潮湿环境下的有机物中，包括孵化器里破损的鸡蛋、通风系统、家禽垫料、饲料、水线料槽等。
曲霉病是非传播性疾病，通过吸入孢子而感染。初始感染通常发生在孵化场。烟曲霉孢子（无性孢子）通过蛋壳裂缝 或卵内注射后的微裂缝）进入种蛋气室， 使得在气室中有真菌生长（真菌性气室）。对着光看，有死胚的蛋呈绿色。孵化场中的污染来自在孵化期间打开受感染的种蛋。孵化场内的感染也可以源于风道或其他设备。在孵化场感染之后，造成雏禽感染。
吸入污染饲料或禽舍垫料中的孢子也可感染曲霉病。湿垫料中的真菌生长产生大量孢子，当在垫料干燥后孢子会被释放出来。这就是为什么有时在发现雏禽（鸡、鸭、鹅）感染很长时间以后在成年禽中也会出现曲霉病病例。
霉曲霉菌属中有致病性的种，特别是烟曲菌和黄曲菌，能产生毒素，参与曲霉菌对家禽的致病作用。
二、临床症状和病变
曲霉在孵化场被污染的雏禽在感染后3-5天出现呼吸道症状：由于气管阻塞而烦躁不安、呼吸急促、张嘴呼吸，很快发生死亡。有的呼吸困难但没有啰音或其他呼吸道杂音。在这种急性呼吸道疾病中，1-3周龄雏禽的死亡率为5-50%。存活禽常表现出慢性呼吸症状，生长停滞，可能嗜睡并发育不良，死亡率为5%。其他临床症状有：斜颈、中枢神经系统异常、结膜水肿等。在慢性感染的成年禽中，该病可能维持亚临床状态并逐渐发展到呼吸困难。有时气管和鸣管中曲霉病引发的渗出物会导致窒息。
曲霉肉芽肿皮炎与疫苗接种后感染的并发症有关。
曲霉病有单侧眼感染，初期流泪，然后出现结膜炎。在呼吸道（气管、支气管、肺、气囊）中发现有病变。大体病变有差异，从小斑块直至 1-9毫米大的白色到黄色结节。气囊中的病变可能显示菌丝体，产生带有分生孢子的分生孢子梗。烟曲霉形成孢子的菌落是蓝绿色的，肉眼可以看到。也可在脑、眼和内脏中看到肉芽肿。年龄较大禽的肺部病灶会相当大，肺部生长着有黄色的纤维蛋白渗出物。